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SDPD Internet CourseSemaine 9 Achèvement de la
détermination de structure et
Lectures Nous en sommes à l'étape finale d'une détermination de structure sur poudre. Lorsqu'il s'agit de données de diffraction de poudre, il n'y a pas d'alternative, une structure (coordonnées atomiques, paramètres d'agitation thermique, etc) doit TOUJOURS être affinée par la méthode de Rietveld. Ne présentez JAMAIS au final un affinement de structure sur des amplitudes de facteurs de structure "|Fobs|" extraits (ils sont biaisés). Démarrez vos lectures cette semaine par les articles originaux de Hugo Rietveld. Visitez completement le site et les liens hypertexte. Le livre de référence pour la méthode de Rietveld est incontournablement : B3 - The Rietveld Method
La page Web de présentation de la liste de discusion Rietveld est une bonne source de départ. Les archives de cette liste de discussion sont une mine d'informations. Notez que vous avez des archives anciennes et des nouvelles sur ce site, toutes deux pourvues d'un moteur de recherche par mot-clé. Sur le même site est donnée une liste des auteurs les plus prolifiques utilisant la méthodes de Rietveld pour résoudre des problèmes de chimie inorganique (ICSD database). Un article récent donne des conseils
et des trucs à propos de la méthode de Rietveld, écrit
par des membres de la CPD
(Commission on Powder Diffraction, IUCr). Vous devriez le lire absolument.
Vous devriez vous abonner (gratuit) à la "lettre de nouvelles" CPD newsletters, si ce n'est pas déjà fait. Deux articles très importants ont été publiés à la fin du RRRR (Rietveld Refinement Round Robin) que vous devriez également lire : Hill, R. J. Rietveld refinement round robin. I. Analysis of standard X-ray and neutron data for PbSO4. J. Appl. Cryst. 25, 589. Hill, R. J., Cranswick, L. M. D. International Union of Crystallography. Commission on Powder Diffraction. Rietveld refinement round robin. II. Analysis of monoclinic ZrO2. J. Appl. Cryst. 27, 802. A titre indicatif, vous pouvez réaliser une recherche dans les journaux de l'IUCr en utilisant le mot-clé "Rietveld". Finalement, lisez le chapitre
3.4 du didacticiel SDPD. Des exemples sont traités montrant
comment compléter et affiner une structure en alternant les applications
de la méthode de Rietveld et des synthèses de Fourier différence
à partir des "|Fobs|" (voyez la version
anglaise du didacticiel, plus complète).
Logiciels à télécharger Une liste à jour de logiciels de type Rietveld ainsi que de logiciels associés (pour faire des synthèses de Fourier, voir les diagrammes calculés, observés et différence, etc) peut être trouvée au site Web du CCP14. Une conférence sur ce sujet des logiciels Rietveld par Lachlan Cranswick en dit plus. Une autre liste donne ces logiciels Rietveld utilisés en SDPD. Clairement, les logiciels Rietveld les plus utilisés par les experts en SDPD sont dans le domaine public :
De nombreux didacticiels
à propos de logiciels Rietveld sont disponibles (GSAS, FULLPROF,...)
au CCP14.
Exercices 1- Complètez la détermination de structure et l'affinement de Na5Cr3F14 et de Pb2CrF7. Utilisez les données des semaines précédentes. 2- Un diagramme de diffraction de poudre de K2TiF6 est enregistré (Cu-Kalpha, géométrie Bragg-Brentano, monochromateur graphite dans le faisceau diffracté, porte échantillon horizontal à remplissage vertical). Faites ce que vous pouvez de mieux en appliquant le méthode de Rietveld, partant des coordonnées atomiques de la base de données ICSD. Identifiez quel est le problème principal avec ce diagramme ? Dans chacun des cas , expliquez brièvement
votre stratégie, et produisez le fichier .sum si vous utilisez FULLPROF,
ou un résumé équivalent des résultats finaux
si vous préférez appliquer un autre logiciel Rietveld (incluez
tous les paramètres affinés, leurs déviations standard
et les facteurs de reliabilité).
Principaux logiciels sélectionnées pour la correction FULLPROF, SHELXL, STRUPLO, GFOUR... La prochaine et dernière session
sera consacrée au niveau 2 de l'achèvement de la détermination
de structure et affinement par la méthode de Rietveld.
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